Stjórn Mannréttindastofnunar Íslands er kosin af Alþingi til fjögurra ára í senn. Hlutverk stjórnar er að móta áherslur í starfi í samráði við framkvæmdastjóra og fylgjast með starfsemi og rekstri stofnunarinnar.
Stjórnin hefur auk þess það hlutverk að skipa framkvæmdastjóra og ráðgjafarnefnd stofnunarinnar.
Núverandi stjórn var kosin af Alþingi í nóvember 2025.